Dodici anni fa, vi era Kyubi, un Demone Volpe che terrorizzava il pianeta, seminando panico, morte e distruzione con le sue nove code. Solo una persona era in grado di competere con questo nemico: questi era il Quarto Hokage, Yondaime. Egli spense la sua vita, sigillando il mostro all'interno del corpo di un bambino, Uzumaki Naruto, che marinando le lezioni dell'Accademia Ninja ogni giorno,finisce col non apprendere nulla, venendo di conseguenza bocciato all'esame per salire al grado di Genin. Il bambino però, all'insaputa di quanto avvenuto nel corso della sua nascita e incosciente dell'entità all'interno del suo corpo, cresceva detestato ed evitato da tutti, diventando poco a poco un vero e proprio teppistello dispettoso.
Ma a rivelare a Naruto il motivo dell'astio che la gente del Villaggio della Foglia provava per lui, è Mizuki-Sensei, che sfrutta il nostro amico per conquistare il Rotolo Proibito in possesso del Terzo Hokage. Infatti, Naruto, soggiogato da Mizuki, pensa che l'unico modo per superare l'esame e far riconoscere ad Iruka il suo valore, sia imparare alcune delle tecniche presenti nel rotolo. Scoperte le sue origini il ragazzo fugge, venendo poi salvato da una persona con un passato simile al suo, l'unico che gli ha voluto veramente bene: Iruka-Sensei. Naruto che difenderà Iruka da Mizuki usando l'unica tecnica che è riuscito ad apprendere dal Rotolo, la KageBunshin No Jutsu, e recupererà il Rotolo, venendo innalzato alla condizione di Genin. Incomincia cosi il cammino per la lunga strada che lo porterà a diventare l'Hokage più forte che sia mai esistito, conquistando il rispetto e l"ammirazione delle persone che finora lo hanno sempre odiato a priori. Inizia qui, la grande storia di Uzumaki Naruto.