Il mokuton è una particolare Kekkei Genkai posseduta unicamente dal Primo Hokage, e successivamente da Yamato, che ricevette il DNA dello Shodaime a seguito di alcuni esperimenti condotti in segreto da Orochimaru, il quale bramava da sempre l’abilità di manipolazione del legno, e cercava quindi di creare un corpo con questa abilità, nel quale poi si sarebbe trasferito. Ma su 60 cavie, solamente Yamato riuscì a sopravvivere, ereditando così questa particolare abilità genetica (Orochimaru sospese gli esperimenti pensando che lo stesso Yamato non fosse sopravvissuto).
Le tecniche eseguibili attraverso questa kekkei genkai si hanno attraverso la combinazione del chakra elementale di terra con quello d’acqua, grazie alla speciale unione di questi elementi, che si ottiene unendo la mano sinistra alla mano destra, in modo tale che le due mani impastino contemporaneamente il rispettivo chakra elementale e sia così possibile creare il legno dal nulla, o addirittura dal corpo dell’utilizzatore.
Si dice inoltre che grazie a questa incredibile abilità lo Shodaime Hokage abbia fondato il villaggio della foglia.
